Mali está situado en África Occidental. Limita al norte con Mauritania y Argelia, al este con Senegal, Guinea y Costa de Marfil; al sur y al oeste con Burkina Faso y Níger.

Ocupa una superficie de 1.240.192 kilómetros cuadrados que está dividida administrativamente en 17 regiones y el distrito de la capital, Bamako.

Se pueden diferenciar dos zonas geográficas distintas, que corresponden al área del Alto Senegal y Níger, en la parte suroccidental, y a la zona del norte, menos fértil, donde se encuentra el Adras de los Iforas, un macizo de 500 a 800 metros de altitud. En general el paisaje es llano, formado por planicies y mesetas; estas últimas se extienden por el sur y suroeste, mientras que en el norte el Sahel deja paso al desierto.

Los ríos que bañan el país son el Senegal y Níger, principalmente.El clima es subtropical y se pueden distinguir tres zonas: de noviembre a febrero una estación fresca por la influencia del Hamattan, un viento del Sáhara, con temperaturas medias de 25 grados centígrados en Bamako. De marzo a junio las temperaturas son más cálidas; en junio comienzan las lluvias; la media es de 35 grados centígrados. De junio a octubre tiene lugar la época de lluvias con medias de 30 grados y una precipitación de 300-400 mm.

Debido a la variedad climática se aprecian distintos tipos de flora. En el norte, la estepa predomina en el Sahel, así como los parajes desérticos y en el sur la sabana arbórea y los arbustos. En algunos lugares, principalmente al borde de los ríos, la vegetación es tan alta que impide ver las aldeas, sobre todo después de las lluvias. Antes de la sequía crece deprisa el sorgo, el mijo, las chufas o los cacahuetes.

En el Parque Nacional de Baule se pueden ver distintas especies de antílopes, búfalos, jirafas, leones y panteras. Hay además otras reservas naturales como Badinko y Kongossombugu. En la zona de Bamako, que corresponde a la sabana, se puede encontrar la típica fauna de este medio tal como elefantes, leones, leopardos, guepardos, hienas, y serpientes de gran tamaño. En los desiertos abundan, como es natural, los dromedarios.