El país colinda con Brasil por el norte y por el oeste está separado de Argentina por el río Uruguay. Al sur se encuentra el estuario del río de La Plata y al este aparece el Océano Atlántico. El noroeste está dibujado con amplias mesetas, riscos y extensos valles. El país está bañado por el Río Negro, el mayor de Uruguay que cruza el país de noroeste a sudoeste y desemboca en el río Uruguay, que separa este país de Argentina.

Uruguay posee una fauna y flora muy especial, gracias a que se encuentra en el punto justo donde se diferencias las zonas tropicales y templadas, por lo que pueden verse especies de ambos ecosistemas.

A pesar de que la geografía dominante son las praderas (que ocupan cerca del 80% del territorio nacional), el paisaje del país es muy diverso. Se contabilizan cerca de 2.500 especies de plantas y unas 224 de árboles y arbustos, más de 100 mamíferos, 400 aves, 60 reptiles y unas 400 especies de peces.

En las praderas prevalecen las gramíneas, numerosas aves y el ñandú, mientras que en las llamadas praderas arboladas, puede verse el ave nacional: el hornero. Por otro lado, los humedales, que ocupan grandes extensiones de tierra (especialmente en los departamentos de Treinta y Tres y Rocha), acogen una importante fauna, entre mamíferos, aves y anfibios. Los Bañados del Este han sido declarados Reserva de la Biosfera. Los bosques ocupan un 3,5 % de la superficie total, siendo el hábitat de numerosas especies de animales como la pava de monte (ave selvática), trepador grande, boyero pico de hueso o carpintero de los cardones.